Abstract

CARRACELAS, B.; PERAZA, P.; CIAPPESONI, G.  and  NAVAJAS, E. A.. A straightforward technique to obtain genomic DNA from nasal swabs suitable for sheep SNP genotyping analysis. Agrocienc. Urug. [online]. 2024, vol.28, e1452.  Epub Dec 01, 2024. ISSN 2730-5066.  https://doi.org/10.31285/agro.28.1452.

El aislamiento de ADN genómico de alta calidad y cantidad es fundamental para los estudios moleculares. Es crucial seleccionar una técnica sencilla y no invasiva para garantizar la recolección eficiente de ADN, particularmente a nivel de los establecimientos. El objetivo de este estudio fue determinar si los hisopados nasales son una matriz biológica apropiada para obtener ADN genómico de buena calidad para el genotipado de SNP. En el estudio se evaluaron y compararon dos matrices biológicas (sangre e hisopados nasales) para el aislamiento de ADN genómico obtenido de 15 ovejas Texel. La determinación de la calidad y la cantidad de ADN se realizó mediante espectrofotometría y electroforesis en gel. Se utilizaron tasas de concordancia de genotipado para comparación. Los resultados mostraron que la concentración media más alta se obtuvo de las muestras de sangre (159,14 ng/μl), mientras que de las muestras de hisopados nasales la concentración media fue menor (130,12 ng/μl), pero la diferencia no fue significativa. En cuanto a la pureza, el ADN obtenido a partir de hisopados nasales presentó una relación A260/A280 mayor (1,96), mientras que el obtenido de muestras de sangre fue de 1,90. El rendimiento total del ADN obtenido a partir de muestras de sangre (15,91 µg) fue significativamente mayor que el obtenido a partir de hisopados nasales (6,51). Las tasas de concordancia de sangre e hisopados nasales fueron altas (media = 0,984). En conclusión, nuestros resultados indican que es posible obtener ADN de buena calidad a partir de hisopados nasales; sin embargo, se debe optimizar el protocolo de extracción de ADN.

Keywords : chip de SNP; extracción de ADN; hisopado nasal; ovinos; análisis de concordancia.

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